原标题:基于公共数据证明基因是重要的
自人类基因组公布之后,组学的技术迅猛发展,从早期的芯片到现在高通量测序,每天都在产生大量的数据。我们搞研究,尤其是医学方面的疾病研究,大家常比较头疼,能做的组学别人做过了,研究的分子别人也基本上做过了,自己不容易找到新的研究点。
当你在为idea发愁的时候,别人开始对发表的数据进行挖掘,分析,写文章。于是出现了很多生信的文章,对于这些文章,我们常感觉不屑,其实小编本人也不喜欢这种二次加工的文章,也感觉不如自己做实验发现的东西实在。
其实我们做机制研究,探讨分子互作机制的时候,也是可以使用公共数据进行分析,毕竟一个机制的猜想,分子作用轴的提出,不管基于文献还是公共数据分析,都是在用别人研究的结果。现在无数的科学家在研究这个病,我们不去学习别人的东西,可能自己埋头研究到头来发现早就是别人前几年就研究剩下的,虽然很充实,不免缺乏价值。
不管你怎么看待公共数据分析,你都需要站在别人的肩膀上往前走。本期,我们讨论一篇文献,看文章如何使用公共数据进行挖掘分析,甚至写成了一篇文章。我个人感觉更大的价值在于做后续机制的时候,我们可以使用数据分析的方法为我们构建机制进行预测。比如挑一个分子,这个分子跟疾病密切相关,找该分子的相互作用分子,如何找?都是通过数据分析挖掘出来的,了解这些公共数据分析的思路,会极大推动机制研究进展。如果你的猜想都可以基于数据分析,那么显然,找到重要规律的概率会高很多。
主要讨论内容:
(1)文献通常是如何证明一个基因是重要的?
(2)做实验和挖掘公共数据是一样的吗?
(3)在自己的研究中如何使用公共数据?
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